Nowe badania dla pacjentów z rakiem jelita grubego

Caris Life Sciences® ma przedstawić wyniki, które zapewniają głębsze zrozumienie, że ekspresja genów guza związanych ze stopniem narażenia na lek, stratyfikowana według statusu p53, jest powiązana z wynikami klinicznymi powszechnych schematów chemioterapeutycznych stosowanych w leczeniu przerzutowego raka jelita grubego (CRC). Wyniki te zostaną zaprezentowane na dorocznym spotkaniu Amerykańskiego Towarzystwa Badań nad Rakiem (AACR) w 2022 r., które odbędzie się w dniach 8–13 kwietnia 2022 r. w Nowym Orleanie w Luizjanie.

Badania z plakatem zatytułowanym „Prognostyczne i prognostyczne sygnatury genów indukowanych lekami dla pacjentów z rakiem jelita grubego spersonalizowane w oparciu o status p53 i leczenie FOLFOX, 5-FU, oksaliplatyną lub irinotekanem” (streszczenie nr 1231) były prowadzone przez Wafika El-Deiry , MD, Ph.D., FACP, dyrektor Brown University Legorreta Cancer Center, prodziekan w Szkole Medycznej Warren Alpert, członek Caris' Precision Oncology Alliance (POA). POA firmy Caris to rozwijająca się sieć wiodących ośrodków onkologicznych na całym świecie, które współpracują w celu rozwoju onkologii precyzyjnej i badań opartych na biomarkerach. Praca ta jest prezentowana w Nowym Orleanie przez Lindsey Carlsen, absolwentkę patobiologii w EL-DEIRY Lab w Brown.

Celem tego badania była identyfikacja predykcyjnych biomarkerów dla chemioterapii stosowanych w CRC. W badaniu wykorzystano linie komórkowe CRC do identyfikacji genów o zróżnicowanej ekspresji po leczeniu 5-fluorouracylem, irynotekanem lub oksaliplatyną i stratyfikowano sygnatury w oparciu o status p53. Na podstawie tych badań in vitro naukowcy zbadali następnie, czy te geny i sygnatury genów mogą przewidzieć wyniki u pacjentów z CRC po chemioterapii (FOLFOX, 5-fluorouracyl, irinotekan lub oksaliplatyna). 2,983 próbki typu dzikiego i 6,229 próbek od pacjentów z CRC p53 z utratą funkcji przeanalizowano za pomocą sekwencjonowania DNA/RNA nowej generacji w Caris Life Sciences. Wyniki dotyczące przeżycia w świecie rzeczywistym wywnioskowano z danych dotyczących roszczeń ubezpieczeniowych i szacunków Kaplana-Meiera. Zarówno prognostyczna, jak i nieprognostyczna ekspresja genów miała istotny wpływ na wyniki przeżycia po zastosowaniu określonych leków.

„Badanie to pomaga nam zrozumieć znaczenie sygnatur genów w wykazaniu zwiększonej zdolności predykcyjnej w porównaniu z indywidualnymi transkryptami” – powiedział El-Deiry. „Łącząc badania podstawowe i kliniczne, badania te pozwalają nam lepiej zrozumieć, które terapie z większym prawdopodobieństwem przyniosą korzyści pacjentom z CRC”. Badanie wykazało, że ekspresja genów nowotworowych związanych z ekspozycją na lek może przewidzieć wyniki po leczeniu chemioterapią:

• Wysoki poziom mRNA EGR1 i FOS niezależnie prognozuje odpowiedź na FOLFOX u pacjentów z guzami p53 typu dzikiego.

• Niski poziom mRNA CCNB1 koreluje z dobrym rokowaniem pacjentów z CRC z guzami niosącymi mutacje utraty funkcji TP53.

• Niska ekspresja BTG2 przewiduje lepsze rokowanie u pacjentów z guzami z mutacją MSI-High TP53.

• Sygnatury genów mogą wykazywać zwiększoną zdolność predykcyjną w porównaniu z indywidualnymi efektami transkrypcji.

„Caris koncentruje się na biomarkerach, które mogą przewidywać odpowiedź pacjenta na najnowsze terapie, ale także wypróbowane i prawdziwe chemioterapie, takie jak FOLFOX”, powiedział dr W. Michael Korn, dyrektor medyczny w Caris. „Jesteśmy podekscytowani, widząc możliwości badań translacyjnych wzmocnione niesamowitymi danymi multiomicznymi i narzędziami analitycznymi, które Caris opracował i nadal robi postępy”.

Kompleksowe profilowanie molekularne Caris ocenia cały egzom (DNA), cały transkryptom (RNA) i ekspresję białka, zapewniając niezrównane zasoby i idealną ścieżkę do prowadzenia badań translacyjnych w celu przyspieszenia odkryć w celu wykrywania, diagnozowania, monitorowania, wyboru terapii i opracowywania leków aby poprawić kondycję człowieka.

Caris przedstawi dodatkowe dane z badań wykazujących kluczową rolę medycyny precyzyjnej i profilowania molekularnego w leczeniu raka. Wszystkie prezentacje będą dostępne online za pośrednictwem strony internetowej Caris od 8 kwietnia 2022 r.

Dodatkowe prezentacje ujawniają wpływ kompleksowego profilowania molekularnego i potencjalną wykonalność kliniczną

• Kompleksowa charakterystyka zmian FGF/FGFR w inwazyjnych rakach piersi (streszczenie nr 5793) Sygnalizacja FGFR ma kluczowe znaczenie dla proliferacji, migracji, angiogenezy i przeżycia komórek rakowych; Zmiany FGFR stały się klinicznie możliwe do zastosowania w coraz większej liczbie typów raka. W badaniu tym oceniono częstość występowania i charakterystykę licznych zmian FGF/FGFR w ponad 12,000 XNUMX inwazyjnych raków piersi i podkreślono ogromną heterogeniczność zmian FGF/FGFR w różnych podtypach histologicznych i molekularnych, a także w różnych miejscach przerzutów raka piersi. Co więcej, powiązania zmian FGFR i oporności na terapie zostały pokazane w dużej klinicznej bazie danych z dopasowanymi wynikami molekularnymi.

• Charakterystyka genomowa i immunologiczna podtypów EGFR w niedrobnokomórkowym raku płuc (NSCLC) (streszczenie #4119)Podczas gdy guzy NSCLC ze zmutowanym EGFR są ogólnie oporne na inhibitory PD-1/PD-L1, u niewielkiej podgrupy pacjentów może wystąpić trwała odpowiedź . Guzy z mutacją EGFR wykazują znaczną heterogeniczność molekularną, jednak brak jest jasności co do profili genomowych i immunologicznych podtypów mutacji EGFR, a dalsze wyjaśnienie tego może pomóc w identyfikacji pacjentów, którzy prawdopodobnie zareagują na terapie oparte na odporności. Wykorzystując wieloomowe dane molekularne wygenerowane przez sekwencjonowanie DNA i RNA nowej generacji na dużej kohorcie nowotworów NSCLC, badanie to potwierdza zmniejszoną immunogenność związaną z większością podtypów mutacji EGFR objawiającą się biomarkerami, w tym PD-L1, TMB i CD8+T infiltracja komórek; i ujawnia rzadkie mutacje EGFR związane z korzystnym profilem immunologicznym, które mogą sugerować odpowiedź na terapię immunologiczną.