CDC potwierdza, że ​​COVID-19 został wykryty w USA już w styczniu

CDC potwierdza, że ​​koronawirus został wykryty już w styczniu
CDC potwierdza, że ​​koronawirus został wykryty już w styczniu

Od 21 stycznia do 23 lutego 2020 r. Agencje zdrowia publicznego wykryły 14 przypadków choroby koronawirusowej w USA w 2019 r. (COVID-19), wszystkie związane z podróżami z Chin (1,2). Pierwszy przypadek w USA niezwiązany z podróżą został potwierdzony 26 lutego u mieszkańca Kalifornii, który zachorował 13 lutego (3). Dwa dni później, 28 lutego, w stanie Waszyngton potwierdzono drugi przypadek niezwiązany z podróżą (4,5). Analiza czterech linii dowodów zapewnia wgląd w czas wprowadzenia i wczesnej transmisji SARS-CoV-2, wirusa powodującego COVID-19, do Stanów Zjednoczonych przed wykryciem tych dwóch przypadków.

Po pierwsze, nadzór syndromiczny oparty na zapisach z oddziałów ratunkowych z powiatów dotkniętych pandemią wcześnie nie wykazał wzrostu liczby wizyt z powodu choroby podobnej do COVID-19 przed 28 lutego. Po drugie, retrospektywne badanie SARS-CoV-2 około 11,000 1 próbek układu oddechowego Lokalizacje w USA od 20 stycznia nie wykazały żadnych pozytywnych wyników przed 18 lutego. Po trzecie, analiza sekwencji wirusowego RNA z wczesnych przypadków sugerowała, że ​​pojedyncza linia wirusa importowanego bezpośrednio lub pośrednio z Chin zaczęła krążyć w Stanach Zjednoczonych między 9 stycznia a 2 lutego, a następnie przez kilka importów SARS-CoV-XNUMX z Europy.

Wreszcie wystąpiły trzy przypadki, jeden u mieszkańca Kalifornii, który zmarł 6 lutego, drugi u innego mieszkańca tego samego hrabstwa, który zmarł 17 lutego, i trzeci u niezidentyfikowanego pasażera lub członka załogi na pokładzie statku wycieczkowego Pacyfiku, który wypłynął San Francisco 11 lutego potwierdza tajemniczą cyrkulację wirusa do początku lutego. Dane te wskazują, że trwała transmisja społeczna rozpoczęła się przed wykryciem pierwszych dwóch przypadków w USA niezwiązanych z podróżami, prawdopodobnie wynikającymi z importu jednej linii wirusa z Chin pod koniec stycznia lub na początku lutego, a następnie kilku importów z Europy. Powszechne pojawienie się COVID-19 w całych Stanach Zjednoczonych po lutym podkreśla znaczenie solidnych systemów zdrowia publicznego w szybkim reagowaniu na pojawiające się zagrożenia zakaźne.

Nadzór Syndromiczny

Poprzez National Syndromic Surveillance Program amerykańskie agencje zdrowia publicznego otrzymują w czasie rzeczywistym dane z oddziałów ratunkowych w około 4,000 placówek opieki zdrowotnej w 47 stanach USA i Dystrykcie Kolumbii. W 14 powiatach z wczesnymi przypadkami COVID-19 nabytymi przez społeczność nie zaobserwowano znacznego wzrostu odsetka chorób podobnych do COVID-19 (gorączka i kaszel lub duszność lub trudności w oddychaniu lub umieszczenie kodu diagnostycznego koronawirusa) przed 28 lutego.

Nadzór nad ostrą infekcją SARS-CoV-2 Badanie Seattle Flu Study (5) rozpoczęło monitorowanie ostrych chorób układu oddechowego w obszarze metropolitalnym Seattle w listopadzie 2018 r. Pod koniec lutego 2020 r. Rozpoczęto badanie próbek przy użyciu odwrotnej transkrypcji - łańcuchowej reakcji polimerazy (RT- PCR) na obecność SARS-CoV-2. Pierwszy pozytywny wynik laboratoryjny dla SARS-CoV-2 został wykryty 28 lutego w próbce pobranej 24 lutego. Po tym wykryciu, niezidentyfikowane próbki pobrane wcześniej zostały retrospektywnie przebadane na obecność wirusa. Nie było pozytywnych wyników wśród 5,270 1 próbek dróg oddechowych pobranych w okresie od 20 stycznia do 5 lutego (6) (T. Bedford, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Waszyngton, komunikacja osobista, 2020 maja 21). Pierwsza próbka, która dała wynik pozytywny spośród tych retrospektywnie przebadanych próbek, została zebrana 21 lutego. W ciągu tygodnia rozpoczynającego się 1,255 lutego, osiem z 0.6 próbek (29%) dało wynik pozytywny, aw następnym tygodniu 1,862 z 1.6 (2%) badanych próbek. pozytywny. Dwie sieci badań skuteczności szczepionek przeciw grypie, mające ośrodki w sześciu stanach (Michigan, Pensylwania, Tennessee, Teksas, Waszyngton i Wisconsin), przeprowadziły retrospektywne testy próbek układu oddechowego od pacjentów z ostrą chorobą układu oddechowego pod kątem SARS-CoV-497 za pomocą RT-PCR. W ośrodku w Waszyngtonie żaden z 19 okazów pobranych w dniach 24 stycznia – 25 lutego nie dał wyniku pozytywnego; pierwszą próbkę, która dała wynik pozytywny, pobrano 2,620 lutego. W pięciu innych miejscach (Ann Arbor i Detroit, Michigan; Pittsburgh, Pensylwania; Temple, Teksas; Marshfield, Wisconsin; i Nashville, Tennessee), żadna z 19 próbek pobranych w styczniu 29–2 lutego uzyskał pozytywny wynik testu na SARS-CoV-22. Od 2020 maja 0.2 r. Cztery (<3,000%) z około 18 próbek pobranych od dzieci i młodzieży w wieku <1 lat zapisanych do New Vaccine Surveillance Network † w okresie od 31 stycznia do 2 marca dały wynik pozytywny na SARS-CoV-20. Najwcześniejszy pozytywny wynik pochodzi z okazu zebranego XNUMX marca w Seattle.

Analiza filogenetyczna

Analiza różnorodności genomowej SARS-CoV-2 z wczesnych przypadków COVID-19 z obszaru Seattle wykazała, że ​​większość wirusów należała do jednego kladu (klad ze stanu Waszyngton), którego najnowszy wspólny przodek istniał około 18 stycznia i 9 lutego (oszacowanie punktowe = 1 lutego). § Przewidywana sekwencja genomu tego wirusa progenitorowego była zgodna z tą z pierwszego amerykańskiego przypadku importowanego COVID-19, który wystąpił u mężczyzny, który przybył do Seattle z Wuhan w Chinach , 15 stycznia i zachorował 4 dni później. Jednak możliwe jest również, że klad ze stanu Waszyngton powstał z wirusa o podobnej lub identycznej sekwencji od innej osoby z zakażeniem SARS-CoV-2. Analiza wirusów w Kalifornii i północno-wschodnich Stanach Zjednoczonych od lutego do połowy marca sugeruje, że miało miejsce kilka importów wirusów, głównie z Europy, po których nastąpiło przeniesienie wirusa w Stanach Zjednoczonych.

Znane przypadki dotyczące osób bez odpowiedniej historii podróży

Przed 26 lutego dwa znaczące przypadki COVID-19 miały miejsce w hrabstwie Santa Clara w Kalifornii: jeden u kobiety, która zachorowała 31 stycznia i zmarła 6 lutego, a drugi u niespokrewnionego mężczyzny, który zmarł w domu między 13 a 17 lutego. Żaden z nich nie podróżował po świecie w tygodniach poprzedzających ich śmierć. RNA SARS-CoV-2 wykryto za pomocą testów RT-PCR w CDC z pośmiertnych próbek tkanek od tych pacjentów. Te zgony zostały potwierdzone przez lekarza sądowego jako zgony związane z COVID-19. Dochodzenie w tych sprawach jest w toku. Wybuchy COVID-19 miały miejsce podczas dwóch kolejnych rejsów statku wycieczkowego Grand Princess (7). Sekwencja genomowa wirusów z tych epidemii znajdowała się w obrębie kladu stanu Waszyngton, co sugeruje, że pasażer lub członek załogi zarażony tym wirusem był na pokładzie statku, który opuścił port w San Francisco 11 lutego i udał się w rejs w obie strony. Tożsamość tej osoby jest nieznana. Dyskusja Informacje z tych różnorodnych źródeł danych sugerują, że ograniczone przenoszenie SARS-CoV-2 przez społeczność w Stanach Zjednoczonych miało miejsce od drugiej połowy stycznia do początku lutego, po imporcie SARS-CoV-2 z Chin. Ten import zapoczątkował linię, klad stanu Waszyngton, który następnie rozprzestrzenił się na obszar metropolitalny Seattle i prawdopodobnie gdzie indziej. Kilka importów SARS-CoV-2 z Europy miało miejsce w lutym i marcu. Nie wiadomo, ilu nas infekcje wystąpiły w lutym i marcu, ale ogólna zapadalność na chorobę przed 28 lutego była zbyt niska, aby można ją było wykryć za pomocą danych z nadzoru zespołu ratunkowego. Nie są również znane daty wprowadzenia zaimportowanych wirusów do Stanów Zjednoczonych oraz tożsamość osób, które je niosły. Jednym z możliwych wczesnych źródeł są pierwsze zgłoszone Stany Zjednoczone przypadek COVID-19, który wystąpił u mężczyzny z Waszyngtonu, który zachorował 19 stycznia po powrocie z Wuhan w Chinach 15 stycznia; sekwencja genomu wirusa wyizolowanego od tego człowieka jest zgodna z tym, że jest on możliwym źródłem kladu stanu Waszyngton, chociaż dokładność dochodzenia kontaktowego w tej sprawie i brak zidentyfikowanych przypadków wtórnych przemawiają przeciwko temu (8). Jednak kolejne opublikowane doniesienia wskazywały, że zakażenie SARS-CoV-2 często przebiega bezobjawowo i może dojść do zakażenia przed wystąpieniem objawów (9). Możliwość przedobjawowego przeniesienia rodzi co najmniej trzy inne potencjalne scenariusze w tym przypadku: 1) że wśród kontaktów pacjenta mogło wystąpić jedno lub więcej wtórnych infekcji bezobjawowych, które doprowadziły do ​​dalszego, niewykrytego rozprzestrzeniania się wirusa; 2) że mężczyzna mógł mieć zakażone kontakty przed wystąpieniem objawów (takie kontakty nie zostałyby zidentyfikowane w ramach standardowego zalecanego wówczas badania kontaktów); lub 3) że on i co najmniej jedna inna osoba zostali zarażeni przez innego pasażera podczas tego samego lotu z Wuhan, a niewykryta infekcja rozprzestrzeniła się od innych zakażonych osób dała początek kladowi stanu Waszyngton. Który z tych scenariuszy, jeśli w ogóle miał miejsce, prawdopodobnie nigdy nie będzie znany. Możliwe jest również, biorąc pod uwagę ograniczoną globalną różnorodność filogenetyczną SARS-CoV-2 w tamtym czasie, że klad ze stanu Waszyngton został importowany do Stanów Zjednoczonych przez inną, nieznaną osobę mniej więcej w tym samym czasie. Wyniki testów serologicznych nie zostały tutaj przedstawione, ponieważ serologia (tj. Badanie na obecność przeciwciał przeciwko SARS-CoV-2) może być stosunkowo niewrażliwym sposobem wykrywania nowo pojawiającego się wirusa, zwłaszcza gdy próbki były pobierane losowo, a nie z osób, które są najbardziej narażone na zakażenie (w przeciwieństwie, na przykład, do badań wirusologicznych pacjentów ambulatoryjnych lub hospitalizowanych z ostrą chorobą układu oddechowego) oraz ponieważ testy serologiczne na ogół nie osiągają 100% swoistości, chyba że dostępna jest jakaś forma testów potwierdzających. Na przykład, hipotetyczne badanie serologiczne w obszarze metropolitalnym Seattle (populacja 3.5 miliona) przeprowadzone po pierwszych 3,500 zakażeniach wykazałoby prawdziwą seroprewalencję na poziomie 0.1%, podczas gdy można oczekiwać, że użycie testu o 99% swoistości przyniesie fałszywie dodatnie wyniki. w 10 razy większej liczbie próbek. Niemniej jednak badania serologiczne są przydatne w śledzeniu postępu pandemii po jej ustaleniu i mają potencjalną zaletę w postaci wykrywania wszystkich infekcji, niezależnie od profilu objawów. Ustalenia zawarte w tym raporcie podlegają co najmniej trzem ograniczeniom. Po pierwsze, przedstawione tutaj dane mają charakter retrospektywny. Chociaż są zróżnicowane geograficznie, nie mogą dostarczyć tak ostatecznego obrazu transmisji, jaki byłby dostępny, gdyby szeroko zakrojone testy były dostępne natychmiast po wykryciu wirusa. Po drugie, niektóre z cytowanych badań i prawdopodobnie inne kontynuują badanie próbek retrospektywnie i mogą znaleźć przypadki wcześniejsze niż te przedstawione w niniejszym raporcie. Wreszcie, względna jednorodność filogenetyczna SARS-CoV-2 na świecie w styczniu i na początku lutego ograniczyła to, co można było wywnioskować z analizy genomowej. Niewiele krajów uniknęło importu i trwałego rozprzestrzeniania się COVID-19. W Stanach Zjednoczonych SARS-CoV-2 jest obecnie w szerokim obiegu po kilku importach z Chin, Europy i innych krajów. Kroki są podejmowane w całych Stanach Zjednoczonych system zdrowia publicznego w celu poprawy wskaźników aktywności SARS-CoV-2, w tym rozszerzenie nadzoru syndromicznego wśród oddziałów ratunkowych i zwiększenie dostępności testów na SARS-CoV-2. Biorąc pod uwagę prawdopodobieństwo, że większość USA

#odbudowapodróże

O autorze

Awatar głównego redaktora przydziałów

Główny redaktor przydziału

Naczelnym redaktorem przydziału jest Oleg Siziakov

Dzielić się z...